اين رودخانه به طول 40 كيلومتر با جهتي جنوبي-شمالي داراي دو شاخه است که در فاصله روستاهاي حطيطه و زرقان به هم مي پيوندند. رودخانه زرقان در مسير خود دره عميقي به وجود آورده كه داراي حفره هاي متعدد به صورت غار در طرفين است. مسير رودخانه با وجود مناظر طبيعي چشم نواز از جمله دره هاي زيبا و سرسبز با ارتفاعات بلند و آب و هواي معتدل كوهستاني ييلاقات جغتاي محسوب مي شود. اين رودخانه که از ارتفاعات جنوبي دشت سپيدار سرچشمه مي گيرد سيلاب هاي آن به دشت جوين مي رسد.